Une trentaine d’organisations religieuses sont enregistrées auprès de la section des affaires religieuses du ministère de l’Intérieur à Taïwan. Les organisations religieuses peuvent se faire enregistrer par les autorités centrales à travers leur association nationale selon la loi concernant le management du temple, la loi concernant les organisations civiques, ou le chapitre du code civil qui régit les fondations et les associations. Le 14 mars 2003, le ministère de l’Intérieur de Taïwan a ajouté l’église de Scientology à sa liste des organisations religieuses officiellement reconnues.
« Dès que le demandeur est considéré comme une nouvelle religion, il doit présenter ses propres doctrines religieuses, ses buts, ses écritures, ses rituels, la structure de ses organisations religieuses, etc., au ministère à titre de renseignements. En conséquence, votre organisation a été approuvée en tant qu’organisation religieuse nationale. Donc, c’est maintenant un fait, votre organisation est acceptée comme une nouvelle religion. »