La loi du culte de 1937 exige que les groupes religieux d’Équateur soient enregistrés auprès du ministère de l’Intérieur. Pour cela, une organisation religieuse doit posséder une charte, avoir un statut non lucratif, inclure dans sa demande tous les noms utilisés par le groupe — pour s’assurer que les noms de groupes déjà inscrits ne soient pas utilisés sans leur permission — ; et apporter les signatures d’au moins quinze personnes, normalement les chefs de file de l’organisation.
Le 13 février 1991, les statuts de l’église de Scientology d’Équateur, établis en vertu de la loi des diverses confessions, ont été enregistrés et publiés dans le registre officiel.
« Que les buts et les objectifs de l’église de Scientology d’Équateur sont [...] une philosophie religieuse au plein sens du terme qui amène l’homme vers la liberté spirituelle et la vérité totale. »